Журнал «Критика и семиотика» | Институт филологии СО РАН
главная об институте документы вакансии противодействие коррупции
журналы научные труды конференции электронные ресурсы контакты
Федеральное государственное бюджетное учреждение науки
Институт филологии Сибирского отделения Российской академии наук
(ИФЛ СО РАН)
ENG
DOI: 10.25205/2307-1737
Номер свидетельства Роскомнадзора Эл № ФС 77-84784 
«Критика и семиотика»
In English
Архив выпусков
Требования к оформлению материалов
Порядок приёма и публикации статей
Редакция
Редакционная коллегия и редакционный совет
Издательская этика
Поиск статей:


Адрес редакции: 630090, г. Новосибирск, ул. Николаева, 8. Институт филологии СО РАН.
silantev@post.nsu.ru Тел. 8-383-3301331

Статья

Название: Геном как (гипер)текст: от метафоры к теории

Авторы: C. Т. Золян, Р. И. Жданов

ИНСТИТУТ ФИЛОСОФИИ, СОЦИОЛОГИИ И ПРАВА НАН РЕСПУБЛИКИ АРМЕНИЯ; МОСКОВСКИЙ ПЕДАГОГИЧЕСКИЙ ГОСУДАРСТВЕННЫЙ УНИВЕРСИТЕТ; ИНСТИТУТ ПЕРСПЕКТИВНЫХ ИССЛЕДОВАНИЙ; ИНСТИТУТ ФУНДАМЕНТАЛЬНОЙ МЕДИЦИНЫ И БИОЛОГИИ; КАЗАНСКИЙ ФЕДЕРАЛЬНЫЙ УНИВЕРСИТЕТ

Выпуск 1, 2016Страницы 60-84
УДК: 81’22 / 81’42 / 575.1 / 631.523.13DOI:

Аннотация: С самого начала зарождения генетики было осознано глубинное сходство между языком и процессами обработки и передачи генетической информации. Были предприняты попытки использовать выработанные в лингвистике методы для дешифровки кодирующих белки нуклеотидных последовательностей. Малая информативность такого рода расшифровок была вполне предсказуемой – методики, ограничивающиеся процессами кодирования, в лучшем случае позволяют составить словарь единиц, но не в состоянии описать язык и выявить определяющие для коммуникации структуры смысла и текста. Так, до сих пор остаются невыясненными функции порядка 95 % некодирующих последовательностей ДНК. Только текст (а не знак) может рассматриваться как объект процесса создания – передачи – сохранения – преобразования информации. Общая теория текста должна быть в состоянии описать языковые тексты и процессы их структурирования, функционирования и трансформации, и в то же время представить первичную структуру генома как систему текстов – гипертекст, состоящий из упорядоченного подмножества других текстов. Текст может быть рассмотрен как квазиорганизм, обладающий памятью, креативно-когнитивными характеристиками и коммуникативным потен- Геном как (гипер)текст: от метафоры к теории 61 циалом, а клетка (рибосома) – как обладающая квазиинтеллектом и спо- собностью оперировать абстрактными семиотическими последовательно- стями. Такой подход требует конструирования новой версии семиотики – мультимодальной и текстоцентричной, где исходными базовыми понятия- ми явятся текст и контекст, а знаки и смыслы рассматриваются одновре- менно и как контекстно-зависимые переменные, и как изменяющие кон- текст операторы.

Ключевые слова: геном, генетический код, общая теория текста, геном как (гипер-)текст, биосемиотика

Список литературы:

Барт Р. Смерть автора // Барт Р. Избранные работы. Семиотика. Поэтика. М.: Прогресс, 1989. С. 384–391.

Барт Р. От произведения к тексту // Барт Р. Избранные работы. Семиотика. Поэтика. М.: Прогресс, 1989. С. 413–423.

Бенвенист Э. Общая лингвистика. М.: Прогресс, 1974. 446 с.

Ванюшин Б. Ф. Метилирование ДНК и эпигенетика // Генетика. 2006. Т. 42, № 9. С. 1–14.

Витгенштейн Л. Логико-философский трактат. М.: Иностр. лит., 1958. 131 с.

Гамкрелидзе Т. В. Р. О. Якобсон и проблема изоморфизма между генетическим кодом и семиотическими системами // Вопросы языкознания. 1988. № 3. С. 5–9.

Гаряев П. П. Лингвистико-волновой геном. Киев, 2009.

Гельфанд М. С. Коды генетического языка и естественный язык // Вопросы языкознания. 1990. № 6. С. 60–70.

Ельмслев Л. Пролегомены к теории языка // Новое в лингвистике. М.: Прогресс, 1960. Вып. 1. С. 264–389.

Жакоб Ф. Лингвистическая модель в биологии // Вопросы языкознания. 1992. № 2. С. 135–141.

Золян С. Т. «Бесконечный лабиринт сцеплений»: семантика текста как многомерная структура // Критика и семиотика. 2013а. № 1/18. С. 18–44.

Золян С. Т. Вновь о соотнесенности языка и генетического кода // Вопросы языкознания. 2016. № 1. С. 114–132.

Иванов Вяч. Вс. Границы семиотики: вопросы к предварительному обсуждению // Современная семиотика и гуманитарные науки. М.: Языки славянской культуры, 2010. С. 31–52.

Лотман М. Ю. Двойственная природа текста (связный текст как семиотическое и коммуникативное образование) // Текст и культура: общие и частные проблемы / Под ред. Ю. А. Сорокина. М.: Изд-во Ин-та языкознания АН СССР, 1985. С. 3–20.

Лотман Ю. М. Мозг – текст – культура – искусственный интеллект // Семиотика и информатика. М., 1981. Вып. 1. С. 13–17.

Лотман Ю. М. О семиосфере // Учен. зап. Тарт. гоc. ун-та. 1984. Вып. 641. (Труды по знаковым системам. Т. 17.) С. 5–23.

Лотман Ю. М. Cемиотика культуры и понятие текста // Лотман Ю. М. Избранные статьи. Таллинн, 1992. Т. 1. С. 129–132.

Материалы Международного симпозиума «Язык генома» / Казанский федеральный университет, Академия наук РТ; под ред. Р. И. Жданова. Казань, 2014. 32 с.

Николаева Т. М. Лингвистика текста и проблемы общей лингвистики // Изв. АН СССР. Серия литературы и языка. 1977. Т. 36, № 4. С. 304–313.

Николаева Т. М. Теория текста. Современное состояние и перспективы // Новое в зарубежной лингвистике. М., 1978. Вып. 8. С. 5–41.

Пропп В. Я. Морфология сказки // Вопросы поэтики. Л.: Academia, 1928. Вып. 12. 152 с.

Ратнер В. А. Генетические управляющие системы: Автореф. дис. ... канд. биол. наук. Новосибирск, 1965.

Ратнер В. Генетический язык: грамматика, предложения, эволюция // Генетика. 1993а. № 29. С. 709–719.

Ратнер В. Сравнительная иерархическая структура генетического языка // Генетика. 1993б. № 29. С. 720–739.

Ратнер В. А. Генетический код как система // Биология. Соросовский образовательный журнал. 2000. Т. 6, № 3. С. 17–22.

Ратнер В. А. Хроника великого открытия: идеи и лица // Природа. 2000. № 6. URL: http://vivovoco.astronet.ru/VV/JOURNAL/NATURE/ 06_00/ CODE/CODE.HTML (дата обращения 18.02.2016).

Седов А. Е. Метафоры в генетике // Вестн. РАН. 2000. Т. 70, № 6. C. 526–534.

Седов А. Е. Иерархические концепции и междисциплинарные связи генетики, запечатленные в ее метафорах: количественный и структурный анализ терминов и высказываний // Науковедение. 2001. № 1. С. 135–154.

Соловьев В. В., Кель А. Э., Рогозин И. Б., Колчанов Н. А. Использование ЭВМ в молекулярной биологии. Введение в теорию генетических текстов. Новосибирск, 1988. 92 с.

Степанов Ю. С. Семиотика. М.: Наука, 1971.

Шредингер Э. Что такое жизнь? Физический аспект живой клетки. М.; Ижевск, 2002.

Чебанов С. Российская биосемиотика как школа: проблема институализации. Научные чтения – 2003. Материалы конф. СПб., 2004. С. 164–171.

Якобсон Р. Лингвистика в ее отношении к другим наукам // Якобсон Р. Избранные работы. М.: Прогресс, 1985. С. 387–404.

Augustyn P. What Connects Biolinguistics and Biosemiotics? // Biolinguistics. 2013. Vol. 7. P. 96–111.

Barbieri M. Is the Cell a Semiotic System? // Barbieri M. (ed.) Introduction to Biosemiotics. The New Biological Synthesis. Dordrecht: Springer, 2007.

Barbieri M. Biosemiotics: A New Understanding of Life // Naturwissenschaften. Springer Verlag, 2008a. P. 577–599.

Barbieri M. What is Biosemiotics? // Biosemiotics (1). Springer, 2008b. P. 1–3.

Barbieri M. A Short History of Biosemiotics // Biosemiotics. Berlin: Springer Science, 2009. No. 2. P. 221–245.

Bertalanffy L. Theoretische Biologie. Berlin, 1932.

Bertalanffy L. General Systems Theory. Foundations, Development, Applications. New York, 1968. 289 p.

Beaugrande R.-A. de, Dressler W. Introduction to Text Linguistics. London: Longman, 1994. 270 p.

Bickerton D. Some Problems for Biolinguistics // Biolinguistics. 2014. Vol. 8. P. 73–96.

Dijk T. van. Some aspects of text grammars. A study in theoretical poetics and linguistics. The Hague: Mouton, 1972.

Crick F. H. C. The Genetic Code – Yesterday, Today and Tomorrow // Cold Spring Symposium on Quantitative Cold Spring Harb. Symp. Quant. Biol. 1966. Vol. 31. P. 3–9.

Crick F. Life Itself: Its Origin and Nature. Simon and Schuster, 1981. 193 p.

Elumalai A., Eswaraiah M. Review on application of bioinformatics // Journal of Science. Bioinformatics. 2013. Vol. 3. Iss. 1. P. 21–27.

Emmeche C., Hoffmeyer J. From language to nature – the semiotic metaphor in biology // Semiotica. 1991. Vol. 84 (1/2). Р. 1–42.

Favareau D. The evolutionary history of biosemiotics // Barbieri M. (ed.) Introduction to Biosemiotics. The New Biological Synthesis. Dordrecht: Springer, 2007. P. 1–69.

Galik D. Biosemiotics: A New Science of Biology? // Filozofia. 2013. Vol. 68. No. 10. P. 859–867.

Gamkrelidze T. «Paradigms» in Linguistics and the Problem of the Isomorphism between the Genetic Code & Semiotic Systems // Bulletin of the Georgian National Academy of Sciences. 2009. Vol. 3. No. 2.

Gimona M. Protein Linguistics and the Modular Code of the Cytoskeleton // Barbieri M. (ed.) The Codes of Life: The Rules of Macroevolution. Berlin: Springer, 2008. P. 189–206.

Jaкobson R. Linguistics. Relationship between the science of language and other sciences // Main trends of research in the social and human sciences. The Hague: Mouton, 1970. P. 419–453.

Ji S. Isomorphism between Cell and Human Languages: Molecular Biological, Bioinformatic and Linguistic Implications // Biosystems. 1997. Vol. 44. Iss. 1. P. 17–39.

Ji S. The Linguistics of DNA: Words, Sentences, Grammar, Phonetics, and Semantics // Molecular Strategies in Biological Evolution. Annals of the New York Academy of Science. 1999. Vol. 870. P. 411–417.

Kull K. Organism as a Self-Reading Text: Anticipation and Semiosis // International Journal of Computing Anticipatory Systems. 1998. Vol. 1. P. 93– 104.

Kull K. A Sign Is not Alive – a Text Is // Sign Systems Studies. 2002. Vol. 30.1.

Kull K., Deacon K., Emmeche C., Hoffmeyer J., Stjernfelt F. Theses on Biosemiotics: Prolegomena to a Theoretical Biology // Biological Theory. 2009. Vol. 4 (2). P. 167–173.

Luhmann N. Essays on Self-Reference. New York: Columbia University Press, 1990.

Luhmann N. Social Systems. Stanford: Stanford University Press, 1995.

Maturana H. R., Varela F. J. Autopoiesis and cognition: The realization of the living. Boston: D. Reidel, 1980.

Pattee H. H. The Necessity of Biosemiotics: Matter-Symbol Complementarity the Physics and Metaphysics of Biosemiotics // Journal of Biosemiotics. 2005. Vol. 1 (1). P. 223–238.

Raible W. Linguistics and Genetics: Systematic parallels // Language Typology and Language Universals. An International Handbook / Eds. M. Haspelmath, E. König, W. Oesterreicher, W. Raible. Berlin; New York: Walter de Gruyter, 2001. Р. 103–123.

Rotshild F. S. Laws of symbolic mediation in the dynamics of self and personality // Annals of the New York Academy of Sciences. 1962. Vol. 96 (3). P. 774–784.

Searls D. The Computational Linguistics of Biological Sequences // Artificial Intelligence and Molecular Biology. 1993. Р. 47–120.

Searls D. B. Formal Language Theory and Biological Macromolecules // Mathematical Support for Molecular Biology. American Mathematical Society Press, 1999. Р. 117–140.

Searls D. B. The Language of Genes // Nature. 2002. Vol. 420 (6912). P. 211–217.

Searls D. B. Molecules, Languages and Automata // Grammatical Inference: Theoretical Results and Applications Lecture Notes in Computer Science. 2010. Vol. 6339. P. 5–10.

Shannon C. E. A mathematical theory of communication // Bell System Technical Journal. 1948. Vol. 27 (379–423). Р. 623–656.

Stjernfelt F. Tractatus Hoffmeyerensis: Biosemiotics as expressed in 22 basic hypotheses // Sign Systems Studies. 2002. Vol. 30.1. P. 337–345.

Trifonov E. N. Earliest pages of bioinformatics // Bioinformatics. 2000. Vol. 16. No. 1. P. 5–9.

Trifonov E. N. Codes of Biosequences // Barbieri M. (ed.) The Codes of Life. The Rules of Macroevolution. Springer, 2008. P. 3–14.

Trifonov E. N. Thirty Years of Multiple Sequence Codes // Genomics. Proteomics. Bioinformatics. 2011. Vol. 9 (1–2). Р. 1–6.

Wiener N. Cybernetics: Or Control and Communication in the Animal and the Machine. Paris: Hermann & Cie; Cambridge: MIT Press, 1948.

Witzany G. Review: Marcello Barbieri (ed.) Introduction to Biosemiotics. The New Biological Synthesis. Dordrecht: Springer, 2007. Triple C 5 (3). P. 104–109.

Zhdanov R. I., Ibragimova M. Y. New informational level at genomic DNA: lipids specifically bound to DNA // Genetics and Chemistry Sharing a Language of Discovery: Cell Symposium series, May 23–25, 2012. Boston; Marriott; Cambridge, 2014. P. 29.

Zolyan S. Text as a Multisemantic Entity – a Prolegomenon to Formalization // International Congress Cultural Poliglotism, tо the anniversary of Juri Lotman’s 90th birthday. Tartu, 2012. Р. 57–62.

ИФЛ СО РАН
630090, Новосибирск, ул. Николаева, 8
тел./факс: 8-(383)330-15-18, ifl@philology.nsc.ru
Карта сайта


Дизайн © ИФЛ СО РАН